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細(xì)胞基因編輯服務(wù)
更新時(shí)間：2025-06-26
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廠商性質(zhì)：其他
一、細(xì)胞基因編輯服務(wù)選擇與適用場(chǎng)景
| 技術(shù) | 編輯類型 | 效率 | 適用場(chǎng)景 |
|---|---|---|---|
| CRISPR-Cas9 | 敲除/短片段插入 | 高 | 基因KO、報(bào)告基因敲入 |
| 堿基編輯（ABE/BE） | 單堿基轉(zhuǎn)換 | 中 | SNP糾正（如C→T或A→G） |
| Prime Editing | 精準(zhǔn)插入/缺失 | 低-中 | 復(fù)雜突變（無(wú)需DSB） |
| CRISPRa/i | 基因激活/抑制 | - | 表觀調(diào)控研究 |
二、細(xì)胞基因編輯服務(wù)CRISPR-Cas9基因敲除（KO）流程
1. gRNA設(shè)計(jì)
工具推薦：
CHOPCHOP
Benchling
設(shè)計(jì)原則：
靶向s個(gè)編碼外顯子（確保移碼突變）。
避免脫靶（使用CRISPRoff預(yù)測(cè)）。
2. 載體選擇
質(zhì)粒系統(tǒng)：
lentiCRISPRv2（帶Puromycin抗性）。
RNP系統(tǒng)：
Cas9蛋白 + sgRNA（高編輯效率，低脫靶）。
3. 細(xì)胞轉(zhuǎn)染/轉(zhuǎn)導(dǎo)
| 細(xì)胞類型 | 遞送方法 | 條件 |
|---|---|---|
| HEK293T | 脂質(zhì)體（Lipo3000） | 70%密度，24h后換液 |
| 原代T細(xì)胞 | 電轉(zhuǎn)（Neon系統(tǒng)） | 1600V, 10ms, 3 pulses |
| iPSCs | 慢病毒（低MOI） | 加Polybrene（8 μg/mL） |
4. 篩選與驗(yàn)證
抗生素篩選：
Puromycin（1-5 μg/mL，48-72h）。
基因型鑒定：
T7E1/Surveyor assay：快速檢測(cè)Indel。
Sanger測(cè)序：TA克隆后分析突變類型。
功能驗(yàn)證：
Western blot（蛋白水平敲除）。
三、基因敲入（KI）與點(diǎn)突變（PM）
1. HDR介導(dǎo)的敲入
供體設(shè)計(jì)：
ssODN（100-200 nt）：同源臂40-60 nt + 插入序列。
質(zhì)粒供體：需1 kb同源臂（適合大片段插入）。
增強(qiáng)HDR：
添加RS-1（終濃度7.5 μM）或NU7026（DNA-PK抑制劑）。
2. 堿基編輯（C→T或A→G）
系統(tǒng)選擇：
BE4max（C→T）：窗口位點(diǎn)4-8。
ABE8e（A→G）：窗口位點(diǎn)4-7。
轉(zhuǎn)染條件：
質(zhì)?；騌NP（72h后檢測(cè)效率）。
3. Prime Editing
PE2/PE3系統(tǒng)：
pegRNA設(shè)計(jì)需包含RT模板和PBS序列（使用PE-Designer）。
四、原代細(xì)胞與難轉(zhuǎn)染細(xì)胞優(yōu)化
| 挑戰(zhàn) | 解決方案 |
|---|---|
| 低轉(zhuǎn)染效率 | 電轉(zhuǎn)優(yōu)化（如原代B細(xì)胞用Amaxa Nucleofector） |
| 高毒性 | 使用RNP（比質(zhì)粒更溫和） |
| 克隆形成率低 | 流式分選（GFP報(bào)告系統(tǒng)）或有限稀釋法 |
五、質(zhì)量控制與脫靶分析
1. 編輯效率檢測(cè)
NGS：擴(kuò)增靶位點(diǎn)后深度測(cè)序（>10,000X）。
流式細(xì)胞術(shù)：若插入報(bào)告基因（如GFP）。
2. 脫靶評(píng)估
預(yù)測(cè)工具：
COSMID
實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證：
全基因組測(cè)序（WGS）或GUIDE-seq。
六、經(jīng)典應(yīng)用案例
| 編輯類型 | 應(yīng)用 | 案例 |
|---|---|---|
| TP53 KO | 腫瘤細(xì)胞增殖研究 | 驗(yàn)證p53在化療耐藥中的作用 |
| BCL11A增強(qiáng)子編輯 | 胎兒血紅蛋白再激活 | 鐮刀型貧血治療研究 |
| ROS1 G2032R KI | 靶向藥物耐藥模型 | 克唑替尼耐藥機(jī)制探索 |
